Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms