Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms