Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nova1Q9JKN6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms