Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AtrQ9JKK8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms