Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms