Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ybx3Q9JKB3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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