Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms