Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tuba8Q9JJZ2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tuba8Q9JJZ2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tuba8Q9JJZ2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tuba8Q9JJZ2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tuba8Q9JJZ2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tuba8Q9JJZ2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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