Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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