Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra4Q9JJT2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra4Q9JJT2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms