Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl28Q9JIL2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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