Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgi1Q9JIA1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgi1Q9JIA1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms