Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr3bQ9JHJ5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms