Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms