Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParvbQ9ES46 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms