Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms