Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms