Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lima1Q9ERG0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms