Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rapgef4Q9EQZ6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rapgef4Q9EQZ6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms