Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Clca3a2Q9EQR4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Clca3a2Q9EQR4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Clca3a2Q9EQR4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Clca3a2Q9EQR4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Clca3a2Q9EQR4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Clca3a2Q9EQR4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Clca3a2Q9EQR4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Clca3a2Q9EQR4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clca3a2Q9EQR4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clca3a2Q9EQR4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clca3a2Q9EQR4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms