Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rhox9Q9EQM5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox9Q9EQM5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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