Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SgshQ9EQ08 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms