Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp2Q9EPK2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms