Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms