Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Hmg20aQ9DC33 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Hmg20aQ9DC33 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Hmg20aQ9DC33 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Hmg20aQ9DC33 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Hmg20aQ9DC33 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Hmg20aQ9DC33 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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