Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syvn1Q9DBY1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms