Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc97Q9DBT3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms