Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem43Q9DBS1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms