Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SelenooQ9DBC0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenooQ9DBC0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms