Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms