Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp5oQ9DB20 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp5oQ9DB20 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms