Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB07

Ift46, Intraflagellar transport protein 46 homolog, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift46Q9DB07 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ift46Q9DB07 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift46Q9DB07 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Ift46Q9DB07 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ift46Q9DB07 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ift46Q9DB07 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ift46Q9DB07 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift46Q9DB07 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ift46Q9DB07 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ift46Q9DB07 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ift46Q9DB07 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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