Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAX3

Erv3, Endogenous retroviral sequence 3, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erv3Q9DAX3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Erv3Q9DAX3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms