Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn3Q9DAW9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnn3Q9DAW9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms