Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb1Q9DAK3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb1Q9DAK3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb1Q9DAK3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb1Q9DAK3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Rhobtb1Q9DAK3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Rhobtb1Q9DAK3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Rhobtb1Q9DAK3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Rhobtb1Q9DAK3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb1Q9DAK3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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