Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DA42 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DA42 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DA42 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DA42 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DA42 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DA42 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DA42 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DA42 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DA42 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DA42 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DA42 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DA42 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DA42 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DA42 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DA42 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DA42 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DA42 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DA42 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DA42 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DA42 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DA42 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9DA42 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9DA42 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9DA42 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9DA42 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9DA42 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9DA42 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DA42 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DA42 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DA42 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DA42 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DA42 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DA42 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DA42 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DA42 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DA42 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DA42 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DA42 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DA42 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DA42 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DA42 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DA42 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms