Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smco2Q9DA21 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smco2Q9DA21 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms