Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms