Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms