Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmco5aQ9D9D5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms