Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms