Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U4

C1qtnf2, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf2Q9D8U4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1qtnf2Q9D8U4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms