Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms