Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4bQ9D8B3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4bQ9D8B3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4bQ9D8B3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4bQ9D8B3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Chmp4bQ9D8B3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Chmp4bQ9D8B3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Chmp4bQ9D8B3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Chmp4bQ9D8B3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chmp4bQ9D8B3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms