Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms