Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn9Q9D805 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms