Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
2310002L09RikQ9D7L5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2310002L09RikQ9D7L5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms