Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl40Q9D783 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl40Q9D783 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms