Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms