Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4aQ9D6F9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms